Bueno, son dos cosas muy diferentes con una filosofía común.
gvSIG es un proyecto de software libre para SIG en el escritorio, cuenta con una comunidad muy grande de usuarios y desarrolladores y cada vez está siendo más orientado a funcionar como herramienta IDE de escritorio (por ejemplo accediendo a servicios web ayudando en la generación de servicios, consumiendo metadatos, entre otros).
GeoTux no es un proyecto de software, es un portal web que pretende reunir y generar material relativo al software libre para compartirlo a una comunidad de usuarios. En nuestra misión está promover el uso de software libre y estándares abiertos en geomática. Por ejemplo, en cuanto podemos, promovemos el uso de gvSIG para SIG en el escritorio publicitando los encuentros que llevan a cabo a nivel mundial y disponiendo documentos que facilitan el uso del programa.
Ahora, si te refieres a la distribución GeoTux, bueno, es un proyecto de Samuel Fernando Mesa para que los usuarios de GeoTux tengan a disposición un cd con herramientas geoinformáticas libres listas para usar, entre ellas, gvSIG.
Saludos, espero quede todo claro.
