Hola,
Efectivamente para personalizar pmapper con la información que deseas incorporar tienes que modificar los archivos:
* pmapper_demo.map : El cual define las capas geográficas a incluir con sus propiedades (color, atributos), el sistema de coordenadas,entre otros, para mayor información puedes consultar esta pagina.
mapserver.gis.umn.edu/docs/reference/mapfile.
* php_config.php: Este archivo define principalmente las capas que se desplegaran en la tabla de contenido y los botones activos en la barra de funcionalidades.
En este archivo encontraras un arreglo llamado categories, una categoria puede tener un conjunto de capas asociadas, en este arreglo colocas las capas según tu interés, el nombre de la capa es el definido en el archivo pmapper_demo.map.
*config_default.ini: Especifica las rutas para la lectura de los archivos *.map, lenguaje,entreo otros, igualmente se especifican los layers a visualizar en el mapa, en este archivo basta con cambiar la lista de layers presentados en:
; LAYERS/GROUPS DEFINED MANUALLY
allGroups =
defGroups =
Por el nombre de los layers definidos en el archivo pmapper_demo.map
*Los archivos lenguaje_es.php y lenguaje_en.php definen el idioma, puedes modificar el archivo lenguaje_en.php y pasarlo todo a español o en el archivo config_default.ini: en la linea
pm_default_language = en cambiarlo por es
Estos son los archivos que principalmente debes modificar, puedes igualmente remitirte a la documentación de pmapper
svn.pmapper.net/trac/wiki/DocManual
Suerte !